“国家环境保护膜分离工程技术中心”作为国家环境能力建设的重要组成部分，以组织重大膜科技成果在环保领域内的工程化、产业化为主要任务，因此，该中心的成立将有助于解决我国环境技术、工程和膜产业领域中的重大问题、关键问题和共性问题，突出工程化示范项目建设，满足国家环境保护科技需求，为国家环境治理提供技术支持和服务。
2005年国家环境保护部正式批复了由中蓝膜技术有限公司申报的“国家环境保护膜工程技术中心”项目可研报告，报告提出蓝星集团以中蓝膜技术有限公司（蓝星环境工程有限公司）、杭州水处理技术中心等单位为依托，在北京空港工业基地组建了“国家环境保护膜工程技术中心”，经过4年的建设，2009年7月由国家环境保护部科技司组织了专家评审，经过专家组对项目建设内容和配套设施的完成情况评审，膜工程中心通过了项目验收。2010年7月13日经国家环境保护部科技司复函，此次会议正式宣告“国家环境保护膜分离工程技术中心”组建完成。
膜工程中心将按照国家环保部科技司对工程中心运行管理的指导意见，形成由相关企业、大学、研究机构共同组成的工程中心管理机构，推动膜技术在环境保护领域的工程化工作。